曾国藩接求援血书，哀叹曰：遥望杭城，鞭长莫及，忧灼如何！

清军坚守杭城两月，粮食渐尽，王有龄谕藏粟家赈廪同食，犹不足遍给。又尽杀马匹，分给每人肉二两，米少许，然卒无补于饥者，有食人肉者，至于辗转沟洫而后已，计一月内饿死者不下十余万人。

杭城饿殍遍地，人气已散，李秀成屡屡射谕入城，无论军、民、满、汉，肯降者即活。

王有龄亦知城垣不保，冀令城门洞开，百姓可出。

瑞昌不许，道：弃民即弃城也。

王有龄万念俱灰，痛哭流涕。

师爷劝：哭亦无用，吾等殉城，自乃本份；百姓殉城，大可不必。射书出城，咨劝秀成：杭城或破，勿伤百姓。

武林、钱塘、清波诸门清军，数日不食，饥饿难耐，纷纷夺门而出，一发不可收拾。

谭绍光、陈炳文、邓光明、郜永宽趁机掘地炸墙，一拥而入。

城陷之际，浙江巡抚王有龄上吊自裁，浙江提督饶廷选、处州镇总兵文瑞力战身亡。

李秀成顾念王有龄心慈，出资三千两，厚殓之。

外城破，秀成督率大军，围攻满城。秀成射谕劝降，并请旨天京，大赦满人。

洪秀全接旨，思忖再三，允准赦免杭州投降之满人。

秀全旨下，正自嗟叹，英国参赞巴夏礼英国海军司令何伯求见，言欲与天朝合力，打倒清廷，平分中国。

秀全不许，道：朕争中国，意欲全图，事成平分，天下失笑，不成之后，引鬼入邦。

天王懿旨未至，众将欲攻，秀成不允，发谕文曰：天国忠王秀成咨劝杭州将军瑞昌，尔奉尔主之命镇守杭城，吾奉吾主之命来取，各扶其主，尔我不得不由，言和成之事，免伤男女大小性命。愿给舟船，尔有金银，并行带去，如无，愿给助资，送到镇江而止。满洲之人过我大国为帝，此是天命而来，非而自成。满待汉人其情本重，今各扶一君，两不得已，存我之心而为此事也。

杭州将军瑞昌不屑一顾，誓死不降。

李秀成乃令攻击，瑞昌自知必死，投水而逝，副都统杰纯、关福亦随其后。城破，满城之旗兵旗民，几近全亡。

秀成占得杭州，即调米万石，救济灾民；各贫户无本资生，秀成复筹钱二十万串，借其本而求其生，不索其利。

1862年1月7日，李秀成饬令主将邓光明、天将童容海驻守杭州，秀成自率大军，北进淞沪。