在公公的亲自部署下，大明皇帝亲军上千将士分作数队，在方圆数十里范围内严格执行“两过”。

而魏公公自己则率领一支由两百人组成的精兵，往北线深入。

宽奠六堡只是建州占据的六座较大城堡，其余尚有很多大大小小的村寨。凡是汉民开垦过的土地，大部分都有女真人活动。

在“两过”的指导下，明军重点开始了对这些小村寨的清剿。

二十三日，大奠以南的塔沟子寨遭到了一队明军的进攻。

次日，该区域下了一场暴雨。

道路积尸既经积雨暴涨，而青皮如蒙鼓，血肉内溃。秽臭逼人，复经日炙，其气愈甚。前后左右，处处焚灼。室中氤氲，结成如雾，腥闻数里。

后黑图阿拉正蓝旗主力赶到，收敛尸骨数百。

二十四日，宽奠主堡东边的女真村寨有消息说明军保证，如果藏起来的女真人能够出来自首的话，就会得到赦免。

于是，两百多躲藏于山岭中的女真人从山里走了出来，可他们随后就被分成二十或三十人一堆，在几个明军的监督下用绳子捆起来，然后被强迫往南迁移。一些不愿走的女真人被带到不同的地点，之后谁也不知道他们去了哪里。

半个多月后，一个叫纳齐步的女真少年向正蓝旗主阿敏回忆当时的情况。

他说：“那一天，我和我的阿玛收拾好东西正准备去山里打猎，突然寨子外传来铳声，接着便有外边的人跑来说宽奠的明兵过来了。

我阿玛急忙组织族人向山里撤退。当时寨子里除了我们族人外，还有大汗麾下正黄旗的一个佐领，有旗兵近百人，另有汉人阿哈三百多人。可是这么多人听说明军过来都吓得惊慌失措，佐领大人带兵胡乱朝寨子外放了几轮弓箭就纷纷往山里跑。

女人孩子们也在跑，听到明军的铳声，纷纷扶老携幼，带着家里值钱的东西争先恐后逃跑。他们和大汗的旗兵还有那些汉人阿哈混杂在一起，场面极其混乱不堪。

我阿玛本来带我进了山里，可听说我的额娘和几个小弟弟没有来得及跑出来，便折回寨子里接应。可刚跑进寨子里就被明军堵住出不来了。我阿玛还算机警，跑到邻居家的茅房里藏着，听到明军的脚步声后，他毫不犹豫的就跳进了粪坑，用上面擦屁股的干草挡在头上，一个持铳的明军在附近搜了一圈没有发现我阿玛……

之后，明军将寨子里没来得及逃走的女真人和汉人集中到寨子前面的打谷场上，约有五六百人。