在官员选拔任用上，乾隆帝强调干部队伍的年轻化，要求官吏们尽可能年富力强。凡是五十五岁以上的官吏要谨慎使用，而六十五岁以上的官员则要由他亲自定夺是否继续留任。

在官员的绩效考评方面，他使用京察、大计等方式考核官吏，对地方上的布政司与按察司等重臣也加以考绩。

乾隆帝将不称职的官吏分为八类，分别为年老、有疾、浮躁、才力不及、疲软无力、不谨、贪、酷，严明法度，奖惩分明。乾隆帝在位六十余年，降级或处分不合格官吏达六万多人。尤其在惩治贪腐方面，他绝不法外留情。

在他执政前中期，总共处死了十多位位高权重的巨贪，其中包括云贵总督恒文、云南布政使钱度、山东巡抚国泰、陕甘总督勒尔谨、浙江巡抚王亶望等等。尤其兵部尚书兼九门提督鄂善，仅纳贿千两白银即被赐自尽，成为满清官场廉洁自律的典型案例。

乾隆帝也不只是一味重罚贪腐，而是疏堵结合，注意加薪养廉。他为京官加薪，又给地方官吏发放养廉银，以解决官吏及家庭的生活问题，使他们无后顾之忧而安心职守。

最让乾隆帝头疼的，还是军机处的内部斗争。

乾隆帝完善了军机处的建制和职权，加强了军机处的权力，同时扩大了军机大臣的人数。他登基以后的第一任军机大臣有六人，分别是鄂尔泰、张廷玉、讷亲、海望、纳延泰、班第，军机章京则扩充至十六人，满人和汉人各占一半。

然而，以鄂尔泰为代表的满派，和以张廷玉为代表汉派谁也不服谁，明争暗斗得厉害。

这两人都是深受雍正帝信任，受遗命辅佐乾隆执政的总理事务大臣。

鄂尔泰（1680年]—1745年）最大的功绩是改土归流。

雍正年间，鄂尔泰任云贵总督，兼辖广西，他在云南实行设置州县、改土归流。

所谓改土归流，就是废除西南地区各少数民族的土司制度，改由中央政府委派有一定任期、期满调任的流官进行官吏。